| 1 | 吉元 碧 | 2:45.05 | 2019/07/20 | 七帝 |
| 2 | 高木 祐希 | 2:54.37 | 2021/08/13 | 関カレ |
| 3 | 小野崎 歩 | 2:58.19 | 2024/6/8 | 東部 |
| 4 | 三輪 茉莉香 | 2:59.14 | 2016/06/19 | 東部 |
| 5 | 河合 夢果 | 2:59.78 | 2014/06/14 | 東部 |
| 6 | 小野澤 未喜 | 3:00.18 | 2011/08/06 | 関カレ |
| 7 | 新井 佑奈 | 3:02.48 | 2022/08/05 | 関カレ |
| 8 | 河村 綾子 | 3:05.66 | 2009/08/10 | 全国公 |
| 9 | 石川 夏子 | 3:05.8 | 2008/08/23 | 都国公 |
| 10 | 春川 真紀 | 3:09.8 | 1987/01/01 | 東部 |
| 11 | 久保田 文 | 3:10.6 | 1997/01/01 | 東京都 |
| 12 | 田中 希実 | 3:11.10 | 2022/05/28 | 東部 |
| 13 | 山本 緑 | 3:11.3 | 2010/08/21 | 都国公 |
| 14 | 水田 優紀 | 3:12.5 | 1986/01/01 | 七帝 |
| 15 | 梶村 綾子 | 3:12.75 | 1995/01/01 | 理工系 |