| 1 | 松本 恭太郎 | 1:00.84 | 2024/9/5 | インカレ |
| 2 | 富永 航平 | 1:01.17 | 2012/04/02 | 日本選手権 |
| 3 | 岡崎 健斗 | 1:01.39 | 2014/1/25 | 都選手権 |
| 4 | 中西 祥旗 | 1:03.71 | 2024/9/5 | インカレ |
| 5 | 持田 隼人 | 1:04.08 | 2024/5/17 | 夢カップ |
| 6 | 渥美 翔太郎 | 1:04.60 | 2012/08/04 | 関カレ |
| 7 | 佐々木 翔 | 1:05.07 | 2023/06/17 | 東部国公立 |
| 8 | 石井 了 | 1:05.57 | 2019/04/20 | 都春季 |
| 9 | 井上 翔太 | 1:06.18 | 2008/07/19 | 七帝 |
| 10 | 羽賀 遼太郎 | 1:06.19 | 2024/7/20 | 七帝戦 |
| 11 | 藤島 実 | 1:06.20 | 1986/01/01 | 日本選手権 |
| 12 | 鈴木 智也 | 1:06.71 | 2014/08/2-4 | 関カレ |
| 13 | 和泉 貴也 | 1:07.05 | 2017/08/07 | 関カレ |
| 14 | 酒井 諒 | 1:07.83 | 2016/08/12 | 全国公 |
| 15 | 横田 海八 | 1:08.47 | 2024/1/28 | 冬六 |